第一，企业对《条例》不了解。由于《条例》实施时间不长，一些企业对《条例》不了解，所以虽然有的企业具备备案条件，且已经开展了特许经营活动，但尚未按《条例》要求进行备案。这需要我们进一步加大对《条例》的宣传，引导这些企业尽快履行备案义务。

第二，有些企业已经开展了特许经营活动，但由于《条例》与原来的《办法》相比，对特许经营企业的要求更高，如“两店一年”、“需要拥有经营资源、成熟的经营模式等”条件，所以暂不具备备案条件的企业，正在不断地创造条件或进行整改，有的企业已经积极和备案机关进行了沟通。对于这类企业，我们将给予积极指导，帮助其完成备案。

第三，还有少数企业原来具备备案条件，并且过去曾经开展了特许经营活动的企业，由于自身或其他的原因，现在或以后不打算再从事特许经营，故不需要申请备案。

第一，受到商务主管部门的行政处罚。备案是《条例》所规定的管理性的强制规范，《条例》明确规定　，特许人未按条例规定向商务主管部门备案的，由商务主管部门责令限期备案，逾期仍不备案的，处5万元以上10万元以下的罚款，并予以公告。

第二，对特许经营活动产生不利影响。尽管备案从性质上说，是一个事后的告知性行为，但是根据《条例》的规定，这种告知包含了部分对于特许人资格确认的内容，同时由于备案实行网上公告制度，即根据《条例》规定，只要通过备案的企业都会通过政府网站予以公告，通过备案对被特许人的加盟决策起到一定的积极引导作用。与此相对，如果已经从事特许经营的特许人在2008年5月1号以后还没有备案，投资人将会对特许人的招商资格和特许经营能力产生质疑。第三，会增加经营风险，降低诚信度。随着政府部门信息共享机制的建立和逐步完善，不履行备案义务的企业将受相关行政管理部门、行政执法机关以及司法机关的关注，特别是因不备案遭受行政处罚后，可能影响到企业开设分公司的批准或影响年检注册，同时会增加败诉的可能性

第三，会增加经营风险，降低诚信度。随着政府部门信息共享机制的建立和逐步完善，不履行备案义务的企业将受相关行政管理部门、行政执法机关以及司法机关的关注，特别是因不备案遭受行政处罚后，可能影响到企业开设分公司的批准火影响年检注册，同时会增加败诉的可能性