商标在申请中，依据《商标法》，对于不符合注册商标显著性、可视性标志的特征，经商标局要求申请人修改的，如果该商标不做修改或修改后仍不适宜注册，商标局将核发驳回通知，导致该商标被驳回。

 （一）商标被驳回的几种主要情形：

商标被驳回的，商标局应书面通知申请人。对于外国申请人，将通知其官方商标代理机构。申请人可在收到该通知的15日内向商标评审委员会申请复审。当事人对商标评审委员会的决定不服的，可以自收到通知之日起30日内向人民法院起诉。

（三）商标被驳回对特许人的影响：

如果被特许人在加盟时，特许人商标授权中仅拥有一个受理过程中的商标，并且在许可使用过程中该商标被驳回，双方可能面临的法律后果：

首先，申请中的商标不是注册商标，特许人对于该商标没有专有权，任何人都可以使用该商标，故不应存在授权问题。对于某些法律学者认为，未注册商标所有权人对未注册商标具有的占用、使用、收益和处分的权利，因此，也包括对商标的使用许可权。但笔者认为，该未注册的商标可能拥有某些权利，但并不是事实上的权利，不拥有商标法意义上的权利，而是根据其他法律的规定拥有的其他法定权利，如著作权、商号权等。

其次，在签订商标使用许可合同时，应充分向被许可人说明其商标的真实状态，否则，就构成合同欺诈。对于因欺诈而订立的合同，被特许人可依《合同法》行使撤销权。合同被撤销后，因该合同取得的财产，应当予以返还；不能返还或者没有必要返还的，应当折价补偿。有过错的一方应当赔偿对方因此所受到的损失，双方都有过错的，应当各自承担相应的责任。

对于充分进行披露义务的特许人，在订立合同后商标被驳回的，应及时告知被特许人，商标使用许可合同因商标被驳回而导致解除的，尚未履行的，终止履行；已经履行的，根据履行情况和合同性质，当事人可以要求恢复原状、采取其他补救措施，并有权要求赔偿损失。

因此，当特许人只有受理中的商标时，应按照《商业特许经营信息披露管理办法》第5条的规定，充分向被特许人书面说明提供商标的真实情况，从而在此基础上订立特许经营合同，充分保障合同双方的权利义务，为今后企业的良好发展打下坚实的基础，避免日后因特许人未拥有注册商标而进行授权，导致特许经营合同被撤销或解除等纠纷。